河北醫科大學是河北省重點骨干大學，初名北洋醫學堂，1894年由直隸總督北洋大臣李鴻章于天津創辦，是中國近代第一所官辦西醫院校。辛亥革命后，1912年1月19日教育部頒發《普通教育暫行辦法通令》，北洋醫學堂改為北洋醫學校。1912年10月22日，教育部又頒發《專門學校令》“十六”號令，據此1913年(民國二年)9月北洋醫學校更名為直隸公立醫學專門學校，并開始招收本科生。1915年學校遷至保定。
1937年7月7日抗日戰爭全面爆發，學校被迫停辦。1946年1月復校招生。1949年4月更名為河北醫學院。1958年學校由保定遷至石家莊。1995年，原河北醫學院、河北中醫學院、石家莊醫學高等專科學校三校合并，改稱河北醫科大學。2013年河北中醫學院恢復獨立建制。2016年，教育部、國家衛生計生委、河北省人民政府正式簽署共建河北醫科大學協議。“十三五”期間，學校制定了“建設特色鮮明的高水平醫科大學”的發展目標。